国土部门违规将宅基地批与他人修建房屋

刘建模于87年取得宅基地证，于88年修建砖房一栋，93年由于地界之争被第三方组织人员用炸药炸毁，2000年国土局以该宅基地证一直有效为由不予换证，期间黄某对该地实施侵权被依法制止，而后冯某实施侵权，其理由为在小组抓阄抓的，早在87年以前该地由于修路被征，已经补偿该小组，之后一直辗转各地要求停止侵权，国土部门一直悬而不决，今年冯某却能依法在此地修建房屋。有当事人的证词，宅基地证，当年征收土地补偿该组的文件。无上诉。现在国土部门以房屋拆除后两年没修建房屋判定该证无效。当年争议双方为此地界的双方乡政府，与刘建模无关，且无安置无赔偿。 请问依法该证是否有效？ 国土部门是否有违规？ 诉求:乡政府与侵权者冯某给与赔偿并恢复刘建模宅基地的使用权。